Post 5: El microbioma humano 👫

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Published: July 22, 2020

Alexandre Almeida es un científico que además de ser el primer autor la siguiente investigación, me ayudo en mi tesis de licenciatura. Razón por la que le dedico esta publicación a forma de gratitud. Además, me enseño que por más ocupado que puedas estar, siempre hay un espacio que darse para poder ayudar a una persona que te lo pida.

Los microbios nos acompañan desde que nacemos hasta después de la muerte y son responsables de nuestra salud al ayudarnos en la incorporación de nutrimentos; por ejemplo: la vitamina B12 esencial para el funcionamiento del cerebro es producida exclusivamente por procariontes [F1]. Dada su importancia en nuestra salud, en 2008 se inicio al proyecto “Microbioma humano” para conocer los microorganismos causantes de la salud y la enfermedad. El proyecto progreso y se logró cultivar muchas bacterias y secuenciar sus genomas a partir de regiones del cuerpo como la boca, vagina, la piel y los intestinos (a partir de la materia fecal), siendo esta última parte del cuerpo la región que más bacterias tiene.

Con la secuenciación masiva de ADN (la metagenómica, en este caso) se ha podido a secuenciar los genomas de los microbios presentes en nuestros intestinos. En este sentido, el trabajo de Alex y su equipo muestra el gran avance que se ha alcanzado desde aquel 2008. Al analizar muestras intestinales provenientes de 31 países crearon la “Colección unificada de genomas gastrointestinales humanos” que comprende 4,644 especies de procariontes (de ellas, 28 arqueas) representadas por 204,938 genomas. Además, crearon el “Catalogo unificado de proteínas gastrointestinales” que comprende ~15,000,000 de clústers de proteínas representadas por 170,602,708 de secuencias de ADN codificantes [F2].

Con ello se estima que ~71% de las 4,644 especies no se han logrado cultivar en el laboratorio y que faltan muchas más especies por identificar [F3]. Sin embargo, su análisis esta muy sesgado por el origen de las muestras que abarca, pues la gran mayoría proviene de personas de Estados Unidos de América, China y el continente europeo. Aun así, los datos sugieren que la especie bacteriana más abundante en nuestros intestinos es Agathobacter rectalis, así como Methanobrevibacter_A smithii lo es para las arqueas. Además, se sugiere que hay una gran variabilidad a nivel de cepa entre continentes y que curiosamente el 0.2% (34,070) de los de clusters de proteínas son de origen viral.

Toda la información y varias implementaciones más están disponibles para la comunidad en la pagina MGnify. Y respecto a las regiones subrepresentadas como Latinoamérica, ojalá que pronto se pueda retomar la iniciativa de MicrobioMEX [F1] que por el momento está estancada. Tal vez vendiendo la idea en tiempos de la 4T y EAB como “Estudio social responsable del microbioma de las comunidades indígenas y urbanas de la república mexicana y su relación con el maíz nacional y la diabetes” podría ser más fácil obtener financiamiento!

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