Post 23: Un año después de AlphaFold2 📅

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AlphaFold2 (AF2) fue anunciado hace ~2 años. Su publicación de hace apenas ~1 año, es el articulo más famoso de su tipo (que topo), pues han accedido a el ~817,000 personas para leerlo y 5,703 personas lo han citado. ¡En solo un año!

Desde entonces, muchas otras IAs para predecir la estructura de las proteínas han surgido: OpenFold, OmegaFold, UniFold, FastFold, ColabFold, DeepFold, ESM-IF1, RGN2, etc. Sin embargo en mi experiencia usándolas, puedo decir que AF2 sigue siendo la que mejores resultados da, además de ser la IA que más detalles biológicos ha considerado en su entrenamiento. No sabemos cuánto costó el desarrollo de AF2, pero tan solo su entrenamiento se estima entre los 25,000 a 200,000 dólares.

Estamos a unos meses de que se lleve a cabo la CASP15 (Diciembre 10-13), y será muy emocionante ver cuales serán los resultados. Acá les dejo unos cuantos links interesantes respecto a AF2:

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Refs:

Mini documental de AF2 hecho por DeepMind:

El mejor vídeo que he visto pa entender AF2 a detalle:

Historias de como los 100tifikos han resuelto problemas con AF2:

Listas de muchas IAs relacionadas al diseño de proteínas y predicción estructural: