Post 38: Evolución de proteínas 🧬

1 minute read

Published:

 

A lo largo de la evolución algunas proteínas han cambiado más que otras a nivel de secuencia. Proteínas como las histonas son muy conservadas independientemente de la especie. Otras como la albumina han cambiado muchísimo a lo largo de la evolución, pero curiosamente, sus estructuras si se han conservado. Así que, para generalizar una explicación de esto, podemos decir que el grado de divergencia (a nivel de secuencia) permitido para una familia de proteínas es inversamente proporcional a la importancia de su función en la célula. Célula que a su vez se encuentra en un contexto histórico determinado por su ambiente y sus interacciones.

img

Sí les gustan los números, aquí está la correlación de Pearson entre la identidad de secuencia y similitud estructural (via RMDS) de 47 proteínas homologas (betalactamasas clase A). ¿Qué tanto puede divergir una secuencia? Pues quien sabe, en este caso hay homólogos con 16% de identidad de secuencia, pero en otras superfamilias se han registrado homólogos hasta con 8% de identidad. Pero en términos generales, pueden divergir al punto de solo compartir entre un 10-15% de identidad

img

Refs:

1. Reconstructing history with amino acid sequences